MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017342	A	6	6	3	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017342	CCT	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017342	AGTA	2	8	160	167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017342	ATTT	2	8	191	198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017342	TCGA	2	8	210	217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017342	TCA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017342	G	6	6	322	327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017342	CA	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017342	CTC	2	6	449	454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017342	ACG	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017342	ACG	2	6	498	503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017342	ACC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017342	ATGA	2	8	775	782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017342	AGG	2	6	829	834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017342	CAC	2	6	874	879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017342	GTG	2	6	885	890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017342	GTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017342	CCA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017342	CCTA	2	8	969	976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017342	TC	3	6	1089	1094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017342	GCC	2	6	1186	1191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017342	CTC	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017342	TCGC	2	8	1423	1430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017342	TCTA	2	8	1489	1496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017342	TCT	2	6	1543	1548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017342	CAATC	2	10	1616	1625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017342	C	6	6	1651	1656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017342	GGT	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017342	ATG	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017342	GCT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017342	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017342	TGG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017342	AATT	2	8	2146	2153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017342	AAT	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017342	GA	3	6	2260	2265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017342	TCGGT	2	10	2337	2346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017342	ACT	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017342	AG	3	6	2637	2642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017342	TCC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017342	CGT	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017342	AG	3	6	2718	2723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017342	ACA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017342	ATT	2	6	2744	2749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017342	CTT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017342	GAT	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017342	GTC	2	6	2788	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017342	CAA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017342	TTG	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017342	TCGC	2	8	2863	2870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017342	CTA	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017342	TCC	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017342	CTTA	2	8	3025	3032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017342	TCG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017342	TAA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017342	CCA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017342	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017342	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017342	TTTTA	2	10	3242	3251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017342	TTA	2	6	3270	3275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017342	ATT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017342	TACT	2	8	3378	3385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017342	TGG	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017342	ACC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017342	T	6	6	3489	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017342	TAAA	2	8	3501	3508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017342	TCT	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017342	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017342	AT	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017342	AGG	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017342	GTG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017342	GT	3	6	3725	3730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017342	AAC	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017342	GT	3	6	3894	3899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017342	ATG	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017342	TCC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017342	ATG	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017342	CACGA	2	10	4044	4053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017342	GAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017342	CAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017342	TTC	2	6	4147	4152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017342	GCA	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017342	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017342	A	6	6	4532	4537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017342	CG	3	6	4545	4550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017342	AAT	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017342	GCT	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017342	TTAC	2	8	4659	4666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017342	TTC	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017342	TAA	2	6	4682	4687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017342	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017342	CTG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017342	TTACC	2	10	4863	4872	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017342	TAGG	2	8	4996	5003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017342	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017342	AAGC	2	8	5045	5052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017342	CGC	2	6	5089	5094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017342	ATG	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017342	AAT	2	6	5165	5170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017342	T	6	6	5191	5196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017342	TGG	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017342	CCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017342	AATT	2	8	5433	5440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017342	GC	3	6	5449	5454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017342	TC	3	6	5564	5569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017342	AAT	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017342	AGA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017342	ACT	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017342	ATT	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017342	TGG	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017342	CCG	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017342	CCT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017342	CCA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017342	ACTT	2	8	6114	6121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017342	TTAA	2	8	6137	6144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017342	TGT	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017342	GT	3	6	6201	6206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017342	GAC	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017342	TA	3	6	6229	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017342	TTCA	2	8	6239	6246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017342	T	6	6	6275	6280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017342	TTC	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017342	CT	3	6	6307	6312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017342	TCA	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017342	TA	3	6	6483	6488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017342	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017342	ATTT	2	8	6662	6669	25 %	75 %	0 %	0 %	384865887
127	NC_017342	AAT	3	9	6686	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
128	NC_017342	TGAT	2	8	6702	6709	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
129	NC_017342	TAA	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
130	NC_017342	ACC	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
131	NC_017342	TCA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
132	NC_017342	CAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
133	NC_017342	CT	3	6	6913	6918	0 %	50 %	0 %	50 %	384865887
134	NC_017342	TTC	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
135	NC_017342	TTC	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
136	NC_017342	CTT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
137	NC_017342	CTT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
138	NC_017342	CAA	2	6	7185	7190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865887
139	NC_017342	AATC	2	8	7218	7225	50 %	25 %	0 %	25 %	384865887
140	NC_017342	ATTGT	2	10	7234	7243	20 %	60 %	20 %	0 %	384865887
141	NC_017342	ATG	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865887
142	NC_017342	AGC	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865887
143	NC_017342	CCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865887
144	NC_017342	CAT	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
145	NC_017342	TAT	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865887
146	NC_017342	AAT	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
147	NC_017342	TAC	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865887
148	NC_017342	TAA	2	6	7620	7625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865887
149	NC_017342	TTCG	2	8	7642	7649	0 %	50 %	25 %	25 %	384865887
150	NC_017342	TAGT	2	8	7734	7741	25 %	50 %	25 %	0 %	384865887
151	NC_017342	TTC	2	6	7751	7756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
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154	NC_017342	TTC	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865887
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159	NC_017342	TTG	2	6	8170	8175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865887
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162	NC_017342	T	6	6	8356	8361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017342	TAA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017342	AAAT	2	8	8504	8511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017342	ATC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017342	AAT	2	6	8641	8646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017342	ATC	2	6	8649	8654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017342	TAA	2	6	8661	8666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017342	CAA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_017342	ATT	2	6	8689	8694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865888
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260	NC_017342	CAT	2	6	12598	12603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_017342	AATTAA	2	12	13270	13281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
281	NC_017342	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
282	NC_017342	CTT	2	6	13347	13352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
283	NC_017342	AAT	2	6	13380	13385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865894
284	NC_017342	T	6	6	13456	13461	0 %	100 %	0 %	0 %	384865894
285	NC_017342	TCT	2	6	13556	13561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865894
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410	NC_017342	GTT	2	6	18136	18141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865898
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